傳染病繼續(xù)在個(gè)體動(dòng)物和群體動(dòng)物的健康和福祉方面及對(duì)單個(gè)農(nóng)場(chǎng)的盈利方面存在著令人憂慮的影響，最常見的頻率計(jì)算方法是通過計(jì)算患病率來(lái)測(cè)量傳染性病原體或接觸他們的證據(jù)。在一定條件下，發(fā)生率也可以計(jì)算出來(lái)。
然而，對(duì)于感染性疾病來(lái)說，了解他們是如何在一個(gè)特定群體傳播也是有用的，。傳輸?shù)淖顝V泛使用的措施是基本再生數(shù)(R0)，其定義為從一個(gè)典型的感染個(gè)體在完全易感人群產(chǎn)生繼發(fā)感染的平均數(shù)目。不同生育數(shù)量取決于其計(jì)算中使用的假設(shè)和疫情。這項(xiàng)措施將繼續(xù)有效地洞察傳染病流行病學(xué)及其防治的不同方面。一個(gè)基本觀點(diǎn)是R0和群體免疫閾值之間的關(guān)系。
豬群免疫力門檻設(shè)置目標(biāo)在不同的農(nóng)場(chǎng)有不同的標(biāo)準(zhǔn)，為了降低感染的發(fā)病率應(yīng)該提高接受免疫接種的比例。接種疫苗通過長(zhǎng)期控制感染直接影響因?yàn)槲覀兊暮芏嗫刂撇呗浴Ｒ话銇?lái)講，這個(gè)理論提供了一種洞察的努力，需要被放置在量傳染病通過應(yīng)用不同的控制措施，也可以使用直接在人群中疾病傳播的動(dòng)態(tài)模型，以獲得更好的了解疾病的傳播和擴(kuò)散的感染控制策略，或監(jiān)視控制措施是否已產(chǎn)生效果。自非典的出現(xiàn)以來(lái)，傳染病的公共衛(wèi)生和流行病學(xué)已經(jīng)取得了相當(dāng)大的進(jìn)展，無(wú)論是在提取的指示傳遞的參數(shù)方面和方式都是專家用它們來(lái)設(shè)計(jì)有效的，有時(shí)最有效的感染控制策略。盡管他們的目的不同，他們的互補(bǔ)性疾病頻率的措施，有時(shí)大量的數(shù)據(jù)，傳輸豬種群內(nèi)這些措施才剛剛開始出現(xiàn)。流感在豬值得 進(jìn)行研究以這樣的方式，因?yàn)樗膬A向內(nèi)和之間的豬的數(shù)量之間的不同傳播種。流感病毒通常被認(rèn)為是一種病毒與一種相對(duì)簡(jiǎn)單的自然歷史，但它仍然在許多豬種群與知之甚少振蕩循環(huán)地方性。它是公認(rèn)的在該地區(qū)豬的密度與感染的可能性在牛群有關(guān)，但很少有人知道確切的促進(jìn)此類傳輸條件。它也被認(rèn)為是一種人畜共患的傳染病，但更清晰的定義是什么人畜共患病的流感類型是將風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和溝通的目的。因此，這筆捐款將專注于流感在豬和其他物種的一些有趣的近期發(fā)展，因?yàn)樗鼘?duì)數(shù)據(jù)收集和分析有益。
對(duì)感染性的評(píng)測(cè)剛剛開始應(yīng)用在流感病毒在豬群中的感染。早期的報(bào)告是基于理論上的推理，而不是觀測(cè)數(shù)據(jù)。 最近，估算繁殖量開始基于實(shí)驗(yàn)和觀察性研究中獲得的真實(shí)數(shù)據(jù)。采用固定效應(yīng)集合分析。很顯然，對(duì)生殖數(shù)字的估計(jì)是變量。這種變異的來(lái)源應(yīng)進(jìn)一步研究，而這可能導(dǎo)致人們對(duì)傳播的進(jìn)一步了解。然而，還應(yīng)當(dāng)指出的是異質(zhì)性的研究，其中包括接觸模式。異質(zhì)性傳播已被應(yīng)用到非典和流感，因此并不奇怪。它不應(yīng)該成為研究流感及其他傳染病的阻礙。有趣的是，所有的R0估計(jì)是根據(jù)使用現(xiàn)場(chǎng)或?qū)嶒?yàn)動(dòng)物個(gè)體的詳細(xì)縱向測(cè)量獲得的條件。雖然這可能會(huì)是保持傳遞率的最準(zhǔn)確的方法，但應(yīng)注意的是經(jīng)常被獲得生殖數(shù)字和公共衛(wèi)生等重要參數(shù)的流行病學(xué)中不完美的數(shù)據(jù)，往往只是案件中的數(shù)字爆發(fā)的早期階段。例如，在2003年的第一個(gè)非典型肺炎疑似病例被用來(lái)了解這種疾病流行病學(xué) 。同樣，病例數(shù) 根據(jù)不同的設(shè)置，1918年流感大流行期間使用主動(dòng)或被動(dòng)監(jiān)察， 用于建立R0的大小 詳細(xì)的電腦記錄是存在于許多母豬和生長(zhǎng)豬的網(wǎng)站，我們應(yīng)該有數(shù)據(jù)在一定條件下，通知我們病毒的傳播能力。例子可能包括墮胎紀(jì)錄確診新流感入侵和死亡率隨著時(shí)間的推移可能記錄呼吸道癥狀。當(dāng)流感病毒被證實(shí)并且證實(shí)其他病原體不參與。必須細(xì)心，因?yàn)榱鞲?病毒在豬很少引起顯著的死亡率。
流感病毒在豬群內(nèi)的傳播
不同時(shí)期的持續(xù)時(shí)間的作用 理解流感在豬群體的傳輸模式，應(yīng)根據(jù)透徹理解 的流感病毒感染的動(dòng)物個(gè)體水平的自然歷史。不像豬許多其他感染 人群，流感有一個(gè)相對(duì)簡(jiǎn)單的自然史。在實(shí)驗(yàn)條件下，期間 感染及傳染病成為為24小時(shí) ，而豬棚病毒在相當(dāng)數(shù)量的周期為5-7 天 。有效的免疫力是長(zhǎng)期持續(xù)時(shí)間還不是很清楚 。大多數(shù)動(dòng)態(tài)模型，旨在研究流感在其他物種中假定的流感病毒感染會(huì)產(chǎn)生長(zhǎng)期的 免疫和免疫的個(gè)體將維持免疫 。這就產(chǎn)生了一個(gè)易感暴露 - infectiousresistant(SEIR)類動(dòng)態(tài)模型。這可以是用于研究，旨在評(píng)估控制一個(gè)合理的假設(shè) 措施，在相對(duì)短的時(shí)間周期在這些人群中。這樣的假設(shè)是我們可能合理 生長(zhǎng)豬，但也許需要在母豬群仔細(xì)考慮。使用一個(gè)非常簡(jiǎn)單的確定性 模型的基礎(chǔ)上，簡(jiǎn)化的假設(shè)來(lái)說明這一點(diǎn)對(duì)免疫母豬的持續(xù)時(shí)間的假設(shè) 人口，再加上固有的大的替代率，可能對(duì)我們的理解有很大的影響流感病毒的傳播。在該情況下，流感假定產(chǎn)生終身免疫，單介紹的病毒，將導(dǎo)致爆發(fā)，這將在隨后的淡出病毒從該人群。相反，如果我們假定免疫力的平均持續(xù)時(shí)間為1年，我們可以期待的病毒一波又一波 循環(huán)因感染單從母豬人口，沒有考慮流通乳中的作用 仔豬。這也許說明了一個(gè)額外的一點(diǎn)：一個(gè)新的臨床因爆發(fā)傳染病的母豬群是 經(jīng)常歸因于外部破壞的生物安全。然而，至少一些這些爆發(fā)的可能是由于本感染的一種固有的開放人口的自然循環(huán)和免疫持續(xù)時(shí)間所扮演的角色。
許多感控制策略的基礎(chǔ)上最大限度地提高懷孕豬的免疫力，這可能是目前在生長(zhǎng)豬直到晚育苗階段。顯著減少在傳輸報(bào)告時(shí)仔豬暴露于病毒與用于免疫母豬流感病毒，這一發(fā)現(xiàn)也與從業(yè)人員的基本常識(shí)相關(guān)。在同一研究中，感染稍微 減少時(shí)仔豬母源抗體暴露于同一亞型的異源病毒。在 核苷酸序列的水平，H1N1的用于免疫的病毒之間的血凝素的相似性是86%。然而，母源抗體進(jìn)行的作用也有些不確定性。最近的一項(xiàng)觀察性隊(duì)列研究的作者報(bào)告了高流通流感病毒身邊斷奶時(shí)間在研究農(nóng)場(chǎng)之一 。在后者的研究中，仔豬有流感病毒陽(yáng)性鼻拭子，盡管抗體的高水平的血清存在下進(jìn)行。因此，據(jù)推測(cè)感染可能發(fā)生在存在的初乳來(lái)源的免疫力。在另一項(xiàng)觀察性研究，豬在感染母體抗體的存在沒有血清轉(zhuǎn)化，這一發(fā)現(xiàn)與先前的實(shí)驗(yàn)工作協(xié)議 。這可能對(duì)的影響 在生長(zhǎng)豬種群流通流感病毒，因?yàn)槟阁w的免疫力可能會(huì)持續(xù)平均 約8周 ，個(gè)別動(dòng)物中很大的變化。這一次，代表了相當(dāng)大的比例的生長(zhǎng)豬的生產(chǎn)生活。比下兩種不同的流感病毒的預(yù)計(jì)流通在批處理生長(zhǎng)豬的場(chǎng)景拉線在產(chǎn)仔隊(duì)列 80%的母豬免疫的。第一種情形是基于抗感染孕產(chǎn)婦的免疫力完全保護(hù)在接受產(chǎn)婦仔豬的假設(shè)抗體。第二個(gè)方案是基于這樣的假設(shè)仔豬將完全易受感染的存在母源抗體，而不會(huì)發(fā)展主動(dòng)免疫后，他們停止脫落的病毒。雖然這兩個(gè)這些方案是不現(xiàn)實(shí)的，他們是由故意簡(jiǎn)單化，意圖展示如何提高母豬免疫力可以塑造流感病毒的循環(huán)在一個(gè)封閉的人群。在前者的情況下，僅在初始易感動(dòng)物的比例允許的病毒引起的感染在生長(zhǎng)期的后期階段，否則循環(huán)會(huì)被完全停止;而在后一種情況下，病毒的循環(huán)早期啟動(dòng)具有更高的峰值。更多的研究將在豬的生命的早期階段更好地了解流感病毒的流通。
很多時(shí)候，流感病毒循環(huán)的幾個(gè)波已經(jīng)報(bào)道，最簡(jiǎn)單的解釋是假設(shè)不同的動(dòng)物 受感染在不同的時(shí)間。雖然這可能是在某些情況下，一個(gè)合理的解釋，這是令人費(fèi)解 ，最近一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)豬與反復(fù)感染流感病毒>間隔4周后。該病毒是非常相似的，并且在某些情況下，把相同的HA基因的部分堿基序列相比較。
不同的流感病毒和不同的合并感染并發(fā)血液循環(huán)的作用
感染豬的病毒中，不同亞型和變異經(jīng)常發(fā)生。此外，共循環(huán)的病毒已經(jīng)記錄在不同的時(shí)間對(duì)同一批次的豬或同時(shí) 。這明顯的影響流感環(huán)流。合并感染已被記錄在相同的動(dòng)物，以及，這 另外的必要條件是對(duì)重排發(fā)生。事實(shí)上，一個(gè)新的重組在一項(xiàng)研究中，檢測(cè)到參與相對(duì)較少的牛群 。這是一個(gè)有趣的現(xiàn)象。除了最近的一項(xiàng)研究報(bào)告的其中之一出現(xiàn) 每2至3年的重組病毒。1982年和2008年間測(cè)得的歐亞變種;出苗前 甲型H1N1流感大流行。在北美豬群，多個(gè)重組的報(bào)道介紹pH1N1后不久和他們的合作循環(huán)的具體定義良好的人群，應(yīng)進(jìn)一步研究。并發(fā)感染流感病毒和其他呼吸道病原體也經(jīng)常在野外條件下。流感病毒的參與在豬呼吸道疾病已被很好地描述。更少有人知道的影響并發(fā)感染可能對(duì)重要性的流感在人群水平的動(dòng)態(tài)流行病學(xué)參數(shù)。 一個(gè)有趣的觀點(diǎn)來(lái)自nonimmunocompromised和嚴(yán)重的近期比較 免疫力低下的人誰(shuí)每天取樣流感病毒，直到停止脫落。平均脫落的嚴(yán)重免疫功能低下患者的持續(xù)時(shí)間為19天。
不同年齡組之間的接觸作用
在流感病毒的傳播在肥育豬的縱向研究中，Loeffen等報(bào)道不同的模式在法羅到完成牛群和專門整理網(wǎng)站提出肥育豬的流感病毒傳播。流感的發(fā)病率最高，在法羅到完成網(wǎng)站整理周期的開始并在本月底整理期間在專門的精加工工序豬。
這在肥育期的開始高發(fā)并一度沖高到一個(gè)更高的程度。肥育豬和母豬和斷奶仔豬在操作的所有房子之間的接觸 生產(chǎn)類在同一地點(diǎn)和它們之間所產(chǎn)生的傳輸。這一發(fā)現(xiàn)解釋了為什么許多法羅到完成網(wǎng)站有流感病毒的持續(xù)循環(huán)。它仍然有點(diǎn)令人費(fèi)解，為什么一些大的生產(chǎn)以更好的年齡分離系統(tǒng)也有流感病毒的流行循環(huán)。在一個(gè)很一般的水平，答案可能是兩者之間的相互作用：(一)大母豬存欄其中易感染動(dòng)物的口袋可能允許 長(zhǎng)期維護(hù)的病毒，(ii)來(lái)自不同母豬存欄的動(dòng)物有不同程度的免疫力混合，這可能會(huì)允許維護(hù)的病毒群體中在較長(zhǎng)的時(shí)間周期，以及(iii)度的接觸保育和肥育階段在不同年齡組之間。它的情況并不少見有一個(gè)以上保育或?qū)ｉT的欄舍。某些生產(chǎn)系統(tǒng)的現(xiàn)實(shí)情況是，有一些 在不同的建筑物不同年齡組之間的重疊，這可能是造成地方性的因素 流通流感病毒。為了設(shè)計(jì)出更有效的感染控制策略的流感病毒 循環(huán)，我們需要不僅群內(nèi)，也之間更好的理解傳播不同生產(chǎn)類別。最近的報(bào)到也指向這個(gè)方向，特別是在母豬群中尤為明顯。
環(huán)境和流感的季節(jié)性作用
季節(jié)性對(duì)任何傳染病的傳播都具有影響，控制程序是一個(gè)重要的因素。在溫帶地區(qū)，在冬季會(huì)出現(xiàn)季節(jié)性流感高峰。季節(jié)性因素仍然沒有完全被理解，盡管一些觀察和實(shí)驗(yàn)研究指出，濕度和溫度的季節(jié)性作用 。在豚鼠模型表明， 由于氣溶膠和相對(duì)濕度傳輸概率之間的關(guān)系不是線性的。最高在低相對(duì)濕度期間發(fā)生的傳輸，減少在濕度適中，然后再次增加 在65%并停止在80%的相對(duì)濕度。作者的結(jié)論是空氣傳播是最有效的，豚鼠在低濕度和低環(huán)境溫度條件下的實(shí)驗(yàn)?zāi)Ｐ�。有趣的是，低溫也延長(zhǎng)病毒脫落期。與此相反，高濕度并沒有產(chǎn)生影響 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物之間的接觸傳播。這導(dǎo)致這些作者提出的氣溶膠傳輸播放人類在溫帶地區(qū)的重要一環(huán)，而接觸傳播是在熱帶地區(qū)更為重要。相比之下，季節(jié)性流感在豬群體的存在還不是很清楚。普遍的共識(shí)是 一個(gè)季節(jié)性模式減少了現(xiàn)代化的養(yǎng)豬生產(chǎn)系統(tǒng)的出現(xiàn)。
一項(xiàng)研究明確針對(duì)季節(jié)性流感在豬中是在2006年至2008年間歐洲四國(guó)最近進(jìn)行的。無(wú)在流感曝光陽(yáng)性豬或養(yǎng)殖場(chǎng)的比例，季節(jié)之間的差異的證據(jù)可以發(fā)現(xiàn)采樣的基礎(chǔ)上，僅限于夏季和冬季期。豬谷倉(cāng)位于不同氣候區(qū)，現(xiàn)代化的生產(chǎn)系統(tǒng)具有復(fù)雜的系統(tǒng)環(huán)境控制。小氣候條件，如溫度和相對(duì)(絕對(duì))濕度可以有在不同的豬舍和生產(chǎn)類和值得我們?nèi)パ芯扛嗟膫鞑ゾ哂兄匾饬x。
位于不同地點(diǎn)的群體之間的傳播
在一個(gè)地區(qū)和相關(guān)指標(biāo)的動(dòng)物密度往往被認(rèn)為是為流行病例的危險(xiǎn)因素。但鮮為人知的是傳遞的實(shí)際機(jī)制。最近獲得了一些見解�？梢詮陌拇罄麃啽l(fā)馬流感，無(wú)論是在條件和結(jié)論的數(shù)據(jù)是如何記錄和分析到達(dá)。在此爆發(fā)重要的是接觸的追蹤和時(shí)代的準(zhǔn)確評(píng)估臨床時(shí)疫情發(fā)生。利用社會(huì)網(wǎng)絡(luò)分析和鄰近的分析提供了一些洞察的本質(zhì)在傳播疫情的早期階段，而生存分析模型中評(píng)估隨時(shí)間變化的協(xié)變量提供了環(huán)境因素在疾病蔓延，一旦運(yùn)動(dòng)限制作用的精辟觀點(diǎn)在控制。有趣的是，后者的研究確定了時(shí)間的滯后作用的相對(duì)濕度和溫度流感發(fā)病病例中馬增持，這與流行病學(xué)和實(shí)驗(yàn)結(jié)果相吻合流感流通和濕度在人群之間的關(guān)聯(lián)。雖然這是不現(xiàn)實(shí)的期望，流感感染的豬群案件將使用相同的徹底性作為一個(gè)報(bào)告的病例進(jìn)行調(diào)查病，馬流感，在完全易感人群，這些報(bào)告包含的數(shù)據(jù)的一些重要的經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn) 采集和分析。令人鼓舞的是看到一個(gè)廣泛接受在不同的使用場(chǎng)所確定北美的司法管轄區(qū)，無(wú)論是跟蹤疫情或疾病控制項(xiàng)目的目的。最終它 可能導(dǎo)致的是基于空間和網(wǎng)絡(luò)信息的實(shí)時(shí)監(jiān)控系統(tǒng)的發(fā)展。 這些類型的流行病模型研究傳播將成為我們高度集成的必要性生產(chǎn)系統(tǒng)。
A型流感病毒在豬群中傳播的潛力
A型流感病毒是一種與公眾健康高度相關(guān)的病毒性病原體，由于其人畜共患潛力，無(wú)論是反映 在動(dòng)物和人之間增加傳播事件，一些致病最近出現(xiàn)在人類的變種的人群，或兩者兼而有之。新出現(xiàn)的人畜共患的流感病毒的例子越來(lái)越頻繁，最近的時(shí)間。 這包括，高致病性H5N1禽流感(H5N1惠普)，并在中國(guó)最近出現(xiàn)的H7N9流感病毒 。 在北美，在美國(guó)豬源H3N2變種病毒造成超過300人的案件在2012年，其中大部分在 人長(zhǎng)時(shí)間暴露在豬中豬表演。人對(duì)人的傳播情況已經(jīng)假設(shè)在某些暴發(fā)的H3N2病毒。 2009年甲型H1N1流感病毒是豬的基礎(chǔ)上，遺傳信息和物種之間傳輸已報(bào)道在兩個(gè)方向上。在此之前的出pH1N1，一些豬原產(chǎn)重配的H1N1病毒引起感染人 。因此，了解動(dòng)物和人之間、人與人之間的流感病毒的傳播能力很重要，Wolfe等提出關(guān)于這種潛在分類動(dòng)物傳染病的有效方法。據(jù)這種分類，病原體傳播從動(dòng)物到人，然后繼續(xù)有效傳播之中人們有可能引起重大疫病在人的潛力，被認(rèn)為是第四階段的人畜共患病�；谠撏瑯拥姆诸�，第二階段的人畜共患病是動(dòng)物與人之間傳播的疾病，但不是人與人之間; 而一個(gè)III期人畜共患病會(huì)導(dǎo)致人與人之間的一些二次傳播，可能導(dǎo)致局部爆發(fā)。這種分類被考慮的人對(duì)人的傳播能力表達(dá)進(jìn)一步補(bǔ)充在人群的生殖數(shù)量方面 。從這個(gè)角度來(lái)看，階段II，III，和IV人畜共患病有 R = 0，<1，且≥1，病原體在不同人群中的傳播能力可以用各種方法，包括評(píng)估基于血清研究和數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上，病毒學(xué)研究，傳輸實(shí)驗(yàn)，現(xiàn)場(chǎng)研究在實(shí)地調(diào)查觀測(cè)。方法為自限性(即，結(jié)巴)傳動(dòng)鏈，典型的評(píng)價(jià)對(duì)于第三階段的人畜共患病，仍處于開發(fā)階段，但已經(jīng)收到在近代興趣高漲;最近在這方面概述總結(jié)發(fā)展。德塞雷斯等最初提出三種方法來(lái)研究傳遞率接近消滅傳染病，這種情況類似于第三階段的出現(xiàn)人畜共患病，通過：進(jìn)口案例(一)比例(ii)分銷暴發(fā)的規(guī)模和持續(xù)時(shí)間(iii)經(jīng)銷代理爆發(fā)。采用的方法是基于易感個(gè)體的假設(shè)無(wú)邊際泳池的，因此，特別的限制，在明確定義的封閉的人群。 Ferguson等提出了一種基于數(shù)量的方法從動(dòng)物到人的情況下觀察到的，記錄簇的數(shù)目，以及最大爆發(fā)的大小。進(jìn)一步修改這種方法提出了。使用建議的方法，據(jù)估計(jì)，對(duì)H3N2豬源病毒沒有從2009年的pH1N1的M片段為R0可能的估計(jì)為0.2，而對(duì)于H3N2豬源病毒的M片段為0.5 。這個(gè)可以直接在風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估中使用。示出爆發(fā)(即多的人參與一個(gè)傳動(dòng)鏈)的假設(shè)下，預(yù)期大小R =0.5。可以看出，大部分的傳輸將導(dǎo)致感染的單個(gè)個(gè)體;但是也有一個(gè)小概率，這種傳播可能導(dǎo)致鏈，這將導(dǎo)致較大的個(gè)體死亡之前。
了解內(nèi)部和種群之間的流感傳播的作用是直接通知感染控制在不同級(jí)別的策略。最近縱向領(lǐng)域的研究提供了有趣的洞察流感流通在野外條件下的病毒。在生長(zhǎng)豬的群體在不同條件下需要采取類似的研究，特別是母豬。對(duì)于這樣的調(diào)查，分子和傳染病流行病學(xué)的工具應(yīng)進(jìn)一步的發(fā)展。在這方面，估計(jì)衡量傳遞的參數(shù)將特別受歡迎。對(duì)于群體間的傳輸，利用應(yīng)采取的其中考慮的分析方法人口的空間和網(wǎng)絡(luò)特性。對(duì)于出現(xiàn)這種情況，但是，現(xiàn)場(chǎng)數(shù)據(jù)質(zhì)量的提高是需要的。使用唯一標(biāo)識(shí)符對(duì)不同的數(shù)據(jù)源之間的數(shù)據(jù)進(jìn)行鏈接，將繼續(xù)成為一個(gè)必然要求和第一步驟。
